大麥全基因組WRKY基因家族生物信息學分析

毛成志; 王蕾; 孔豆豆; 王寒冬; 張懷剛; 沈裕虎; 徐金青 中國科學院西北高原生物研究所青海省作物分子育種重點實驗室中國科學院高原適應與進化重點實驗室; 西寧810001; 中國科學院大學; 北京100049

關鍵詞:vulgare 轉錄因子 wrky系統(tǒng) 進化分析 

摘要:WRKY基因家族是一類含有WRKY保守結構域的轉錄因子,參與植物眾多生理生化過程,在植物生長發(fā)育、代謝以及脅迫應答等過程中發(fā)揮重要作用。目前,已在多種植物中對WRKY轉錄因子進行了系統(tǒng)鑒定和分析,但是還未見有大麥WRKY基因家族系統(tǒng)篩選和鑒定的報道。本研究利用最新的大麥基因組數(shù)據(jù),經(jīng)生物信息學鑒定共得到98條大麥WRKY轉錄因子,其編碼蛋白質序列長度為117~676 aa。有91條可以定位到大麥7條染色體上并呈不均勻分布,3H染色體上分布最多達25條,6H上最少僅有5條。通過系統(tǒng)進化分析,大麥98個WRKY轉錄因子根據(jù)其保守結構域可分為Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ組,各組分別有10個、52個和36個成員,其中Ⅱ組可進一步分成Ⅱ-a、Ⅱ-b、Ⅱ-c、Ⅱ-d和Ⅱ-e 5個亞組。保守基序分析表明,大麥的20個保守基序中,有6個為WRKY結構域的保守基序,各組內(nèi)部成員擁有一致的保守基序。本研究可為進一步開展大麥WRKY基因的發(fā)掘與功能驗證提供科學依據(jù)。

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