玉米SPP基因家族的全基因組鑒定及表達分析

何冰; 時丕彪; 呂遠大; 陳國祥 南京師范大學生命科學學院; 南京210023; 鹽城市新洋農業試驗站; 鹽城224049; 江蘇省農業科學院種質資源與生物技術研究; 所江蘇省農業生物學重點實驗室; 南京210014

關鍵詞:mays 磷酸蔗糖磷酸酶 家族基因 生物信息學 表達譜 

摘要:磷酸蔗糖磷酸酶(sucrose-phosphate phosphatase,SPP)是蔗糖生物合成途徑中的關鍵酶,其主要作用是將蔗糖-6-磷酸水解成蔗糖。本研究利用生物信息學手段從玉米基因組中鑒定了2個SPP家族基因,命名為ZmSPP1和ZmSPP2,并從系統發育關系、蛋白結構域、基因結構和表達模式等方面分析了該基因家族的特征。結果發現,ZmSPP基因在基因結構上存在明顯差異,但其編碼蛋白的理化性質高度相似,并且均含有S6PP結構域和S6PP_C結構域。表達譜分析顯示,ZmSPP在玉米各組織中均有表達,但ZmSPP1的表達水平顯著高于ZmSPP2,這暗示ZmSPP1可能在玉米蔗糖-6-磷酸水解過程中扮演重要作用。進一步分析授粉阻斷后的葉片RNA測序數據,結果表明阻斷授粉可以抑制玉米葉片中ZmSPP1基因表達,但不影響ZmSPP2基因表達。本研究將為進一步解析玉米ZmSPP基因的功能提供重要依據。

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