基于SNP分型的香菇交配型AS-PCR鑒定

張美彥; 宋春艷; 于海龍; 譚琦; 徐珍; 王瑞娟; 章?tīng)t軍; 尚曉冬 上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所; 農(nóng)業(yè)部南方食用菌資源利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 國(guó)家食用菌工程技術(shù)研究中心; 上海市農(nóng)業(yè)遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 上海201403

關(guān)鍵詞:香菇 交配型 單核體 snp 

摘要:目前食用菌的交配型鑒定通常采用單核體兩兩交配后鏡檢觀察鎖狀聯(lián)合的方式進(jìn)行,工作量大,耗時(shí)長(zhǎng)且易產(chǎn)生人為誤檢。本研究以香菇(Lentinula edodes)菌株"申香215"為例,通過(guò)對(duì)需鑒定交配型的單核體的雙核體親本菌株進(jìn)行基因組重測(cè)序,獲得雙核體交配型A和B因子區(qū)域的序列比對(duì)信息,對(duì)交配型因子等位基因內(nèi)部的SNP位點(diǎn)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,選擇合適位點(diǎn)設(shè)計(jì)引物,采用等位基因特異PCR(Allele-specificPCR,AS-PCR)技術(shù),根據(jù)擴(kuò)增結(jié)果可快速確定單核體的交配型并排除雙核體和雜合體。用該方法鑒定香菇單核體的交配型,提高了鑒定效率和準(zhǔn)確率,該方法可作為分子標(biāo)記輔助育種的一種手段,為食用菌遺傳育種工作提供新的技術(shù)支撐。

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