關鍵詞:globigerinita glutinata 活體浮游有孔蟲 單細胞pcr 克隆技術
摘要:有孔蟲分子鑒定和分子多樣性研究多基于SSU rDNA序列片段分析,但某些浮游種內可能存在基因組內rDNA變化,影響分類學和分子生態學的研究結果。為了研究浮游有孔蟲物種內是否存在rDNA多樣性,本工作以采自熱帶西太平洋的浮游有孔蟲Globigerinita glutinata活體標本作為研究對象,經形態學鑒定后,利用單細胞PCR和克隆技術,獲得5個蟲體的20條SSU rDNA目的片段(300—400 bp),同時對其序列結構進行了研究。結果顯示,同種G.glutinata出現了四類不同的SSU rDNA核酸類型。序列成對分析顯示,該種遺傳距離差異最長可達0.249,遠高于其它物種。此外,同一樣本不同克隆片段中,出現了高達四個不同的SSU rDNA核酸型。序列的差異主要集中在三個不同的高變異區,高可變區的長度范圍為21 bp到63 bp。從差異序列的間隔分布推斷,核糖體基因簇的重組可能是不同SSU rDNA核酸型出現的原因。本工作在國內首次揭示了熱帶西太平洋浮游有孔蟲G.glutinata種內的SSU rD NA核酸型,研究結果表明G.glutinata的種內SSU rDNA變異性極大,復雜的生活史以及假基因的存在或許是造成該現象的原因。
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