電子克隆獲取甜菜富亮氨酸類受體蛋白激酶基因BvLRR-RPK2;1完整編碼區

王希; 陳麗; 趙春雷 中國農業科學院甜菜研究所/黑龍江大學農作物研究院; 哈爾濱150080; 黑龍江省普通高等學校甜菜遺傳育種重點實驗室; 哈爾濱150080; 中國農業科學院北方糖料作物資源與利用重點開放實驗室; 哈爾濱150080

關鍵詞:甜菜 基因克隆 電子克隆 完整編碼區 

摘要:針對前期獲得的甜菜分子標記位點進行分析,以獲得甜菜中該位點相關的基因。結合電子克隆與常規克隆,獲取并驗證目的基因片段,最后預測基因產物結構與功能。結果獲得了一段長3467bp的片段,其中包含一個長3141bp的完整編碼區,編碼一個長1046aa的富亮氨酸類受體蛋白激酶。將基因命名為BvLRR-RPK2;1。基因編碼區在基因組中連續存在,無內含子區域。基因翻譯產物BvLRR-RPK2;1具有一個跨膜結構域,具有LRR-RPK家族的特征性結構域,與已知的LRR-RPK/RLK類蛋白序列相似性在85%以下,與甜菜本身的預測序列在編碼區內部有5個堿基、2個氨基酸的差異。本文獲得了一個甜菜中未經克隆的LRR-RPK2編碼區,并預測了其產物功能。

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